Gaziantep Şahinbey ilçesi Fidanlık Mahallesi Batalhöyük mevkiinde bulunan okulun yapımına 1995 yılında devlet yatırım bütçesi ile “Batalhöyük Lisesi” adı altında başlanmış, Sanko Şirketler Grubu’nun maddi katkılarıyla okul daha sonra “İnci Konukoğlu Lisesi” adını almıştır.
Milli Eğitim Bakanlığı’nın 22 Ekim 1998 tarih ve 14236 sayılı oluruyla okul öğretime açılmıştır. 11 Aralık 1998 yılında zamanın Cumhurbaşkanı Sayın Süleyman Demirel tarafından okulun açılışı yapılmıştır.